吴晓青总结了“十一五”以来环境保护部直属单位环保科技工作进展和取得的成就。他说，作为环保科技工作的中坚力量，近年来环境保护部直属单位紧紧围绕环保重点工作，充分发挥自身优势，不断创新科技工作思路，积极承担环保科技项目，经费超过26亿元；高层次人才队伍发展壮大，两人当选中国工程院院士，中高级技术职称人数比例达45％；环保科技基础条件显著改善，建设环境基准与风险评估国家重点实验室，建成环境卫星中心和一批环境保护部级重点实验室与工程技术中心；环保科技创新工程硕果累累，4项成果获国家科技奖，70项成果获环境保护科学技术奖，完成442项环保标准和一批环境保护技术政策与规范。科技支撑和引领环境保护的作用日益显著，科技工作的战略地位进一步凸显。
吴晓青强调，新时期的环保科技工作，要以环保标准体系建设为统领，加快环保科技创新体系、环保技术管理体系、环保产业培育体系和科技支撑保障体系建设，引领和支撑环境管理战略转型。要不断提升环保标准的科学性、系统性和适用性；进一步优化环保科技创新的顶层设计；加快先进环保技术的示范与推广；要以环境服务业为重点大力发展环保产业；继续深化环保科技体制改革。
吴晓青还要求环境保护部直属单位要争做环境管理“战略转型、科技先行”的排头兵，并在工作中认真处理好以下4个关系:一是要处理好科技创新与服务管理的关系，充分发挥环保科技对环境管理的引领和支撑作用；二是要处理好服务管理与服务市场的关系，要积极进入环保产业发展的第一线，加强环保产品、技术、装备的研发和科技成果的转化，引领我国环保产业的发展；三是要处理好发挥优势与协同创新的关系，提升环保科技资源利用效率；四是要处理好项目申报与过程管理的关系，形成有利于环保科技工作健康发展的良好环境。
