新办法规定，各类排水户应分类别、按照不同的方法进行计量收费。使用自来水的排水户按用水量的90%计取污水处理量，使用自备水源的排水户则视如下三类情况区别计量。
其中，安装有取水量实时监控系统的，按取水量的90%计取污水处理量；未安装取水量实时监控系统，但安装有合格取水计量设施的，按水务部门根据计量设施核实取水量的90%计取污水处理量；既未安装有取水量实时监控系统，也未安装有合格取水计量设施或设施运行不正常的，按日最大取水能力（取水设备铭牌额定流量全时程运行计算或《取水许可证》许可取水量日平均）核定取水量的90%计取污水处理量。
产品以水为原料（如饮料、啤酒、纯净水等企业）和生产过程中水蒸发量大的，其排水量按核定“计征比例”的取水量计取污水处理量。具体核定方法由市水务局会同市物价局另行制定。
按照新办法要求，对欠缴污水处理费的排水户，将参照欠缴水费应交滞纳金标准加收滞纳金。征收部门应及时追缴污水处理费，可通过建立并公布信用记录、媒体曝光等措施加强对欠费行为的处理。
在免征对象上，新办法规定对符合以下条件的排水户免征污水处理费。具体包括：消防救火性质用水的；本市户籍的残疾军人、革命烈士（含因公牺牲和病故军人）遗属、本市户籍的在乡孤老优抚对象、五保户、低保对象；自备有污水处理设施，经处理的污水达到国家或省规定的排放标准，且不使用市政排水设施而直接排入珠江口或狮子洋的；按照《中华人民共和国水污染防治法》、《排污费征收使用管理条例》的规定应缴纳污水排污费，且未使用市政排水设施的。
新办法明确，本市户籍的残疾军人、革命烈士（含因公牺牲和病故军人）遗属、本市户籍的在乡孤老优抚对象、五保户、低保对象等排水户，须凭当地民政部门发放的《优抚对象抚恤补助登记证》和出具的有效证明办理免征手续，并由代收部门（供水企业）报市水务局备案。
经处理的污水达到国家或省规定的排放标准，且不使用市政排水设施而直接排入珠江口或狮子洋的排水户，以及按照《中华人民共和国水污染防治法》、《排污费征收使用管理条例》的规定应缴纳污水排污费，且未使用市政排水设施的排水户，先由市环保局、市水务局提出意见，经市财政局、物价局审核后可免征污水处理费。
